鯨魚洞矗立在小門嶼的北端，原為玄武岩地形，後經海蝕作用，貫穿為一道海蝕拱門，因為外型近似鯨魚將頭露出水面，海蝕的大洞，則是牠的眼框，身體部分深埋海中，因此稱為鯨魚洞。整體高度約7.8公尺，退潮時，能進洞內觀潮聽濤；潮大時，可欣賞巨浪拍打洞口的景象。
 
鯨魚洞也有另外屬於它的典故與傳奇：據說距今約50年前，曾有一條鯨魚，不知何故竄入洞中，不得出而死。當時曾有遠自小池角等人，前往分割鯨肉，亦因此取而為名。
 
海蝕是指海水運動對陸地的破壞性作用，海蝕的力量來自波浪、潮汐和海流，這些因素對沿岸的陸地進行侵蝕。鯨魚洞則是典型的海蝕地形，這種海蝕地形稱為「海蝕拱門」，又稱「天然橋」；海蝕地形會隨著時間而改變模樣，如果鯨魚洞上頂塌下來，就會變成「海蝕柱」。鯨魚洞東側現留有兩支海蝕柱，可能是另一海蝕拱門頂 部崩塌所形成；鯨魚洞與旁邊的海蝕柱是海蝕演變過程的最佳範例。
 
走訪小門鯨魚洞，除了特殊地質的了解，還可以拍些古厝老屋斑駁的照片，附近的小吃有小管麵線.炒小魚干.燒酒螺等在地風味美食。
一般遊客停留時間大約１-２小時。

鯨魚洞地址： 881澎湖縣西嶼鄉11-12號